Cotonou es la capital económica de Benin; además, al ser la mayor ciudad del país, alberga todos los servicios gubernamentales y diplomáticos, convirtiéndola en la capital de hecho, aunque la capital oficial sea Porto-Novo.
Cotonou se encuentra en la costa entre el lago Nokoué y el Océano Atlántico. La ciudad está dividida en dos por un canal, la laguna de Cotonou.
El clima es ecuatorial, alternando dos estaciones lluviosas (de abril a julio, y de septiembre a octubre) con dos secas. De diciembre a enero, la ciudad se ve afectada por fuertes vientos. La temperatura anual varía entre 18 y 35 ºC.
El Puerto Autónomo de Cotonou es uno de los más grandes en África Occidental. Desde el Aeropuerto Internacional de Cotonou, se puede llegar tanto a las capitales regionales como a las mayores ciudades del país: Parakou, Kandi, Natitingou, Djougou y Savé.
Por estas conexiones, Cotonou se ha convertido en un gran centro comercial del África occidental.
